土壤偏酸性或偏碱性都会降低土壤养分的有效性，难以形成良好的土壤结构，严重的会抑制土壤微生物的活动，同时也可能造成重金属中毒，从而影响作物的生长发育。一般情况下在土壤PH值为5.5至6.5之间最适合作物吸收矿物质营养，过酸或过碱都会影响作物对矿物元素的吸收。而土壤中微生物最适宜PH值在6.5至7.5之间，过酸或过碱都会严重抑制土壤微生物的活动，从而影响氮素以及其它养分的转化和供应。
判断土壤酸碱度是否适宜的方法：
1、从土壤颜色进行判断.酸性土壤一般颜色较深（多为黑褐色），而碱性土壤的颜色多呈浅色（多为白色或浅黄色）。盐碱地区土表常有一层白粉状的碱性物质。当然这只是根据经验来判断的，存在一定的误差。
2、示土壤为中性；PH值小于7则土壤为酸性；若PH值大于7则土壤为碱性。需要注意的是不同作物适宜土壤的酸碱度不同。
土壤盐度对根系的影响：每一种作物都有其适宜的土壤盐度范围，超出此范围都会对作物造成一定的负面影响。
三、土壤养分对根系的关系
作物所需的16种营养元素中的氮磷钙锌对其根系生长影响很大。
氮素含量的多少对根系有一定的调控和局部刺激作用，合适量的氮肥可增加根系的灌服和干重量，以及促进根系生长。
磷可以为作物根系提供能量。在作物生长期过程中磷比较集中，在富有生命力的幼嫩组织中（如根尖、茎尖等），根系的含磷量高于茎叶的含磷量。当作物缺磷会影响细胞分裂，导致蛋白质合成下降，糖分运输受阻，从而使得根系生长细弱。
钙多集中于作物生长的成熟部位，幼嫩部位含量较少。钙在植株体内难以移动，一旦缺钙幼嫩部位首先有所表现（如：果实的脐部；顶端生长点；茎、根尖生长点等），会导致生长点的分生组织生长渐弱，从而腐烂坏死。
锌在植物体内影响到生长素（吲哚乙酸）的合成，锌不仅能够促进根茎间生长点的生长，还能促进根尖生长点的生长。作物根系中锌的含量高于地上部分。当锌供应充足时可在根系中积累。当缺锌时叶片失绿是最显著突出的表现，其次是叶片变小；结节缩短；植株生长受抑；同时根系生长也会受到严重抑制（根系长势弱；吸收能力差等）。
四、土壤中微生物对根系的关系
土壤内微生物活动过程中会产生大量的赤霉素和细胞激素类的物质，这些物质在与作物根系接触后能调节作物的新陈代谢，刺激作物的生长，从而促使作物增产。微生物还能分解土壤被固定的矿物质养分，且能将无效的有机质变为有效成分被作物吸收。但上述并不是单一的微生物就能完成的，建议使用复合微生物菌剂。
五、功能性成分生根剂
一般有：黄腐酸；海藻酸；壳寡糖；维生素B族等（2月15日《作物根系差？如何正确使用生根剂》有介绍）
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